에피소드 1. LA X Part I
줄리엣이 폭탄을 터뜨린 줄 모르는 잭, 소이어, 케이트. 눈을 떠 보니.. 다시 현재로 돌아와 있는데 그렇게 고생한 보람도 없이 백조 해치는 이미 지어졌다가 데스몬드가 폭파시킨 그대로다. 그런데 폭파된 해치 저 아래에서 죽은 줄 알았던 줄리엣의 목소리가 들린다. 차까지 동원해 겨우겨우 줄리엣에게 다가간 소이어. 하지만 줄리엣은 꼭 해야 할 말이 있다는 얘기를 끝으로 숨을 거두고 만다. 헐리는 죽은 제이콥을 만나 사이드를 살릴 방법을 알아내고...
에피소드 2. LA X Part II
사이드를 살릴 방법이 있다는 헐리의 말에 따라 소이어와 마일스를.. 제외한 나머지는 모두 사원으로 향하는데 사원으로 통한다는 동굴을 지나면서 '그들'에게 습격을 당해 잡히고 만다. 어쨌든 결국은 사원에 도착하는데 그들의 지도자로 보이는 일본인은 사이드를 사원 안의 어떤 샘으로 데리고 가서 익사시킨다. 한편 무사히 착륙한 비행기에서 내린 승객들. 잭은 아버지의 관이 분실되는 바람에 어쩔 줄을 모르다가 존을 만나 마음의 안정을 찾고, 줄리엣은 에드워드를 쓰러뜨리고 도망치는데, 도망치려고 탄 택시에는 클레어가 타고 있다.
에피소드 3. WHAT KATE DOES
분명히 죽었던 사이드가 멀쩡하게 살아나자 그들이 지도자는 사이드를 데려다가 전기 고문하고 뜨겁게 달군 부지깽이로 지지기까지 하면서 그 어떤 설명도 하지 않는다. 그렇게 심하게 당한 사이드를 보고 화가 나 지도자를 찾아간 잭. 지도자는 약 한 알을 주면서 사이드가 감염됐으니 그 약을 먹여 치료해야 한다고 설득한다. 하지만 잭은 본인이 약을 삼켜 버리고, 깜짝 놀란 지도자는 억지로 약을 뱉게 만든다. 사실은 독약이었던 것이다. 사이드의 몸에 암흑이 자라고 있으며 이 약을 먹여 죽이지 않으면 곧 사이드의 원래 모습은 완전히 사라질 것이라고 한다. 한편 클레어를 빈손으로 차에서 내리게 한 케이트는 클레어의 짐을 풀어 보고 그녀가 만삭이었으며 짐은 모두 아기 물건이라는 걸 알고 클레어를 찾아 나선다. 어쩌다 클레어의 일에 엮여 병원까지 가고...
에피소드 4. THE SUBSTITUTE
리처드는 자신을 따르면 제이콥과 달리 최대한 존중해 줄 것이며 뭐든지 다 얘기해 주겠다는 로크의 제안을 거절한다. 소이어는 로크가 로크가 아니라는 걸 알고도 별반 놀라지도 않고 자신이 여기에 오게 된 이유를 알게 해 주겠다는 얘기에 로크를 따라나선다. 로크와 함께 도착한 낭떠러지 중간의 동굴 천장에는 수많은 이름이 적혀 있는데... 한편, 바깥세상의 존은 헬렌과 결혼을 앞두고 회사에는 세미나에 참석한다고 거짓말하고 개인적인 시간을 보낸 통에 해고되고 만다. 그런데 회사 주차장에서 휴고를 만난다. 자신이 이 회사의 주인이라며 로크에게 일자리를 제공할 곳을 알려준다.
에피소드 5. LIGHTHOUSE
뜻밖에 클레어를 만난 진은 클레어가 뭔가 이상해졌음을 느끼고.. 클레어는 잡아 온 그들의 일원을 죽인다. 헐리는 제이콥의 부탁을 받고 잭을 데리고 등대로 가서 이 섬으로 들어오려는 배에게 길을 알려주려 하는데 잭은 그 등대의 거울에 비친 자신의 어릴 적 집을 보고 제이콥이 어째서 평생 동안 자신을 지켜본 건지 꼭 알아야겠다며 헐리를 다그친다. 하지만 제이콥은 나타나 주지 않고, 결국 잭은 등대의 거울을 산산조각 내 버리고 만다. 한편 바깥 세상의 잭에게는 데이비드라는 아들이 있는데 오래 전 잭과 잭의 아버지만큼이나 소원한 관계다. 하지만 잭의 노력으로 데이비드도 마음의 문을 조금은 여는 듯하다.
에피소드 6. SUNDOWN
사이드는 자신을 죽이려 하는 도겐을 찾아가 담판을 지으려 하고.. 도겐은 사이드는 죽는 게 낫다며 차라리 떠나서 다신 돌아오지 말라고 추방령을 내린다. 사이드가 떠나려는 순간, 로크의 지시를 받은 클레어가 나타나고, 도겐은 잭과 헐리를 찾을 수 없자 사이드를 불러 로크를 죽임으로써 사이드가 선한 사람임을 증명해 보이라고 한다. 사이드는 로크를 만나자마자 가슴에 칼을 꽂지만 로크는 아무런 상처도 입지 않고 오히려 사이드를 설득해 사원 안의 사람들에게 제이콥이 죽었으니 이제 더 이상 사원에 있을 이유가 없으며 해가 지기 전에 사원에서 나와 자신과 합류하지 않으면 모두 죽을 거라는 이야기를 전하도록 한다.
에피소드 7. DR. LINUS
벤은 마일스 덕분에 제이콥을 죽인 사실이 드러나 일라나에게 죽을 위기에 처한다.
자기가 들어갈 무덤을 파고 있는 벤 앞에 불현듯 나타난 로크. 벤에게 자신이 이 섬을 떠나고 나면 이 섬을 이끌어 나갈 사람은 벤 뿐이라면서 라이플이 있는 곳을 알려 주고 일라나가 묶어 놓은 발목의 쇠사슬을 손짓 하나로 풀어 버린다. 그렇게 달아나는 벤. 쫓아오던 일라나를 총으로 제압하고, 알렉스 얘기를 하면서 자신이 심정을 얘기하자 일라나는 벤을 받아 주기로 결정한다.
에피소드 8. RECON
로크와 행동을 같이 하기로 한 소이어는 진, 케이트, 사이드와도 만나게 된다. 그리고 로크의 지시대로 히드라 섬으로 가 아지라 항공 여객기를 찾는 소이어. 그런데 지독한 냄새와 함께 시체들이 즐비한 곳에서 조이라는 여자를 만난다. 자신이 마지막 생존자라는 조이. 소이어는 의심을 늦추지 않고, 결국 조이가 아지라 항공의 생존자가 아님을 알아채지만 숨어 있던 조이의 무장한 동료들에게 제압돼 잡히고 만다. 그들이 데려간 곳은 다름아닌 잠수함. 위드모어를 만난 소이어는 로크를 넘기겠다며 거래를 제시한다.
에피소드 9. AB AETERNO
19세기, 리처드는 병 걸린 아내를 위해 의사를 찾아갔다가 몸싸움 끝에.. 의도치 않게 살인을 저지르고 감옥에 들어간다. 그리고 그곳에서 만난 신부에 의해 노예로 팔려 간다. 리카르도를 싣고 가던 블랙록이라는 배는 폭풍우를 만나 난파하는데 눈을 떠 보니 이상하게도 숲 한 가운데다. 식량과 물이 충분치 않다며 쇠사슬에 묶여 있던 노예들을 죽이던 노예상. 그런데 갑자기 어디선가 나타난 검은 연기 기둥이 배 위의 사람들을 모두 죽이고 노예상마저 죽인다. 혼자서 며칠인지도 모를 시간을 쇠사슬에 매인 채 지내던 리카르도는 죽은 아내 이사벨라를 보는데, 검은 연기 기둥이 다시 나타나 이사벨라가 도망친 후 검은 옷을 입은 남자가 나타나 이곳은 지옥이고, 이사벨라는 악마가 데려갔다고 한다. 그리고 칼을 주며 악마를 찌르라고 하는데...
에피소드 10. THE PACKAGE
로크가 선을 찾아오겠다고 하지만 진은 그의 말을 믿지 않고 캠프를 떠나려 한다. 하지만 그 순간 어디선가 마취총이 발사돼 캠프의 모든 사람들이 의식을 잃고, 진은 위드모어의 부하들에게 끌려간다. 위드모어를 만난 진은 비행기 안 선의 짐에서 나왔다는 디지털 카메라를 통해 아직 한 번도 만나지 못한 딸 지연의 모습을 본다. 한편 이 답답한 상황에 화가 난 선은 혼자 예전에 가꾸던 밭에 가서 화를 삭이는데 불쑥 로크가 나타나 진과 함께 있다며 같이 가자고 한다. 역시 로크를 믿지 않는 선은 있는 힘껏 도망치다가 나무에 부딪히는데 의식을 찾은 후에는 영어를 알아들을 수는 있지만 말은 한국말밖에 하지 못한다.
에피소드 11. HAPPILY EVER AFTER
위드모어에 의해 다시 섬으로 끌려온 데스몬드. 위드모어는 엄청난 전자기파 속에 살아남은 사람은 데스몬드가 유일하다며 모두를 위해 데스몬드가 희생해 줘야 한다고 한다. 그리고 강한 전자기파에 노출된 데스몬드는 오세아닉 815편에서 내려 짐을 찾으러 가는 완전히 다른 생을 경험한다. 그곳에서 데스몬드는 위드모어의 오른팔로 중요한 일을 도맡아 하는데, 이번에는 위드모어의 음악가 아들과 함께 연주할 '드라이브 섀프트'라는 밴드의 베이스 연주자 찰리 페이스를 콘서트에 책임지고 데리고 오는 일을 맡는다. 어딘지 묘한 찰리와 함께 차를 타고 가다가 찰리 때문에 차가 바다로 곤두박질치고 찰리를 구하려다가 갑자기 뭔가 이상한 장면을 보게 되는 데스몬드. 페니라는 여자가 누구인지, 존재는 하는 여자인지 궁금해진다.
에피소드 12. EVERYBODY LOVES HUGO
리처드의 얘기에 따라 비행기를 폭파시키기로 하고 블랙록에서 다이너마이트를 가져온 일라나. 불안해하는 휴고에게 열심히 설명하던 중 갑자기 다이너마이트가 터져 흔적도 없이 사라진다. 리처드는 다이너마이트를 가지러 블랙록으로 가자고 하고 휴고는 그러자고 해 놓고는 한 발 먼저 블랙록에 도착해 아예 블랙록을 폭파시켜 버린다. 불쑥 나타난 마이클이 사람들을 다 죽이려는 거냐면서 막으라고 했기 때문이다. 그리고 제이콥이 로크를 만나야 한다고 했다며 사람들을 설득하는 휴고. 결국 리처드 팀과 휴고 팀으로 나뉘어 로크를 만나러 간다.
에피소드 13. THE LAST RECRUIT
결국 다시 만나게 되는 로크 일행과 잭 일행. 로크는 잭에게 단둘이 얘기할 것을 제안하고 잭은 오래 전 이 섬에 처음 왔을 때 봤던 아버지의 망령이 사실은 현재 로크의 모습을 취하고 있는 바로 그 존재임을 알게 된다. 다 같이 보트를 타고 히드라 섬으로 가서 비행기를 타자는 로크. 소이어는 그 말에 따르는 듯하지만 로크를 전혀 믿지 않는다. 잭, 케이트, 헐리, 선, 라피더스만 데리고 로크의 보트를 가로채는 소이어. 여기에 케이트의 설득으로 클레어까지 가세하지만 잭은 이 섬을 떠나선 안 되는 것 같다며 배에서 뛰어내린다. 한편 바깥세상에서는 소이어와 케이트, 잭과 클레어가 만나고 총을 맞은 선과 진, 데스몬드가 모는 차에 치인 로크가 잭의 병원으로 이송된다.
에피소드 14. THE CANDIDATE
로크의 보트를 타고 섬에 도착해 위드모어를 만나려는 소이어 일행. 하지만 위드모어 쪽에서는 거래는 취소라며 이들을 우리에 가둔다. 잭, 사이드, 로크가 히드라섬으로 와서 소이어 일행을 구하고 비행기로 향하지만 미리 비행기에 도착해 밖에 있던 보초들을 죽인 로크는 비행기 기내 선반에서 C-4 네 덩이를 찾아낸다. 결국 잠수함을 타기고 결정하는 일행. 잭은 돕기는 하겠지만 자기는 가지 않겠다고 한다. 소이어는 이번에도 로크를 따돌릴 계획을 세우고 결국 로크와 클레어만 육지에 둔 채 잠수함은 잠항을 시작하는데 케이트를 치료하려고 가방을 열어 본 잭은 그 안에서 C-4를 발견한다.
에피소드 15. ACROSS THE SEA
언제인지도 모를 아주 오래 전 난파된 배에 타고 있던 한 만삭의 여인이 바다 위로 솟구치고, 섬에 있던 또 다른 여인이 만삭의 여자를 도와 아이를 낳을 수 있게 해 준다. 제이콥이라는 이름의 사내아이가 태어나고, 잠시 후 생각지도 못했던 쌍둥이 동생인 또 하나의 사내아이가 태어난다. 섬에 있던 여인은 쌍둥이의 엄마를 돌로 쳐 죽이고 두 아이를 키운다. 제이콥과는 달리 동생은 늘 바다 저편에 대한 호기심을 갖고 있다. 그러던 어느날, 두 아이는 멧돼지를 사냥하는 남자들을 발견하고, 이 섬에도 다른 사람들이 있다는 사실을 알게 된다. 그리고 둘이 마주앉아 게임을 하던 중, 동생의 눈에만 진짜 엄마의 모습이 보이는데...
에피소드 16. WHAT THEY DIED FOR
클레어를 집에 데려온 잭. 다음날 아침 아들 데이비드와 클레어와 함께 아침 식사를 하던 중 한통의 전화가 걸려 온다. 오세아닉 항공사라면서 아버지 시신을 찾았다는 내용의 전화. 하지만 전화를 건 사람은 다름 아닌 데스몬드다.
데스몬드는 다시 로크의 학교를 찾아갔다가 벤을 만나고, 몸싸움 끝에 로크를 죽이려던 게 아니라 이제 그만 놓게 해 주려는 거라는 알 수 없는 말을 남기고, 그 얘기를 전해 들은 로크는 잭을 찾아간다. 제 발로 경찰서를 찾아간 데스몬드. 사이드와 케이트가 갇혀 있는 유치장으로 들어간다. 그리고 다른 곳으로 이송되던 중 휴고와 아나루시아의 도움으로 두 사람을 빼돌린다.
에피소드 17. THE END
제이콥의 후임자가 되겠다고 나선 잭. 아직은 아무 변화도 느껴지지 않는데 제이콥이 지키라고 한 그 밝은 빛을 향해 가기로 한다. 데스몬드를 이용해 그 빛을 끔으로써 섬을 파괴하려는 로크의 생각을 간파한 소이어는 데스몬드가 갇혀 있는 우물로 향하고, 로크를 만나지만 데스몬드는 찾지 못한다. 로크는 우물 곁의 개 발자국을 따라가 로즈와 버나드의 집을 찾아내고 데스몬드는 두 사람을 위해 로크를 따라 나선다. 결국 중간지점에서 만나는 잭과 로크. 빛이 있는 섬의 중심부에 도착해 데스몬드를 그 아래로 내려보낸다.